Sexymarkers : un outil bioinformatique qui révèle l’expression génétique spécifique au sexe chez les requins blancs

Les requins blancs sont l’un des animaux les plus mystérieux et fascinants de l’océan, mais ils sont également difficiles à étudier et à conserver.

L’un des défis auxquels les chercheurs sont confrontés est de déterminer le sexe des requins blancs, ce qui est important pour comprendre la dynamique, le comportement et la reproduction de leur population.

Jusqu’à présent, le seul moyen fiable de distinguer un mâle d’une femelle requin blanc était de rechercher la présence ou l’absence de fermoirs, qui sont des nageoires pelviennes modifiées que les mâles utilisent pour l’accouplement.

Cependant, cette méthode n’est pas toujours réalisable, en particulier pour les requins de grande taille et potentiellement dangereux, difficiles à capturer ou à observer de près.

Comment fonctionnent les sexy_markers

Une nouvelle étude menée par le CSIRO, l’agence scientifique nationale australienne, a développé un nouvel outil bioinformatique capable de révéler le sexe des requins blancs en fonction de leur ADN.

L’outil, appelé sexy_markers, utilise une approche d’apprentissage automatique pour identifier des marqueurs génétiques spécifiques au sexe à partir de données génomiques.

L’étude, publiée dans la revue Scientific Reports, est la première à rapporter l’existence de chromosomes sexuels X et Y chez les requins blancs, similaires à ceux trouvés chez les humains et d’autres mammifères.

Les chercheurs ont utilisé sexy_markers pour analyser les séquences génomiques de 14 requins blancs d’Australie et d’Afrique du Sud. Ils ont découvert que les requins blancs possèdent 41 paires de chromosomes, dont une paire de chromosomes sexuels.

Les chromosomes sexuels sont XX (femelle) ou XY (mâle) et portent des gènes qui déterminent le sexe du requin.

Les chercheurs ont identifié 148 marqueurs spécifiques au sexe, qui sont des régions d’ADN uniques au chromosome X ou au chromosome Y. Ces marqueurs peuvent être utilisés pour distinguer les mâles des femelles avec une grande précision.

L’avantage des sexy_markers est qu’ils peuvent fonctionner avec n’importe quel type d’échantillon d’ADN, comme le sang, les tissus ou la salive. Il peut également être appliqué à d’autres espèces de requins, à condition que suffisamment de données génomiques soient disponibles.

Les chercheurs ont testé l’outil sur quatre autres espèces de requins : le requin tigre, le requin bouledogue, le requin baleine et le requin léopard. Ils ont découvert qu’ils possédaient tous des chromosomes sexuels, mais avec des nombres et des types de marqueurs différents.

L’outil est également rapide et facile à utiliser, car il ne nécessite que quelques étapes et un ordinateur standard. Les chercheurs l’ont rendu disponible gratuitement en ligne afin que tout le monde puisse l’utiliser pour sexer des requins ou d’autres animaux dotés de chromosomes sexuels.

Pourquoi est-ce important

La capacité de déterminer le sexe des requins blancs et des autres requins est cruciale à des fins de conservation et de gestion.

Par exemple, connaître le sex-ratio d’une population peut aider à estimer son potentiel reproductif et sa diversité génétique. Cela peut également aider à identifier les zones de reproduction potentielles et les schémas de migration.

De plus, connaître le sexe de chaque requin peut aider à surveiller sa croissance, sa santé et ses mouvements au fil du temps.

Les chercheurs espèrent que sexy_markers sera un outil précieux pour les chercheurs et les gestionnaires de requins du monde entier, ainsi que pour le public souhaitant en savoir plus sur ces animaux étonnants.

Ils espèrent également que l’outil inspirera davantage d’études génomiques sur les requins, qui pourront révéler de nouvelles informations sur leur évolution, leur écologie et leur physiologie.

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